梦幻西游中宠物内丹是可以被顶掉的。召唤兽的内丹格子学满如果再想打入新的内丹，新内丹就会随机覆盖掉一个已经存在的旧内丹。无论是低级内丹还是高级内丹，都遵循这个基本规则，这是官方设定的内丹替换机制。
高、低级内丹之间存在区别。当召唤兽已经拥有一个高级内丹时，如果再打上一个新的高级内丹，那么新的高级内丹会百分之百顶掉之前存在的那一个。而如果想打入低级内丹，无论当时高级内丹格子是否被占据，低级内丹都有可能随机顶掉任意一个已有的内丹，这个被顶掉的目标既可能是另一个低级内丹，也有一定几率是那个唯一的高级内丹。
特别需要注意的是内丹层数和顶掉之间的关系。玩家通过战斗领悟或消耗资源提升内丹层数，是为了增强内丹的效果，从1层最高可提升到5层。但当玩家用新内丹去顶掉一个已满层或高层的旧内丹时，旧内丹的高层数效果并不会转移给新内丹。无论被顶掉的是几层的内丹，新打上去的内丹都会以初始的1层状态开始，之前为提升旧内丹所投入的层数成本会完全消失，因此替换高层内丹需要非常慎重。
在实际操作中其实存在一些技巧来应对这种随机性。一个常见的策略是在给召唤兽进阶时，可以先用一些性价比高或暂时不贵的低级内丹打满所有格子并提升到要求的层数以完成进阶，待进阶完成后，再根据自己的最终需求，逐步替换上目标内丹，这样能有效分摊高昂内丹在领悟过程中被顶掉的风险。
